С декабря 1984 года по июль 1987 года он возглавлял Краснодарский горисполком, куда перешел с поста главы Октябрьского района. В 90-е годы работал в краевой администрации.
При его участии были созданы новые участки троллейбусных линий по улицам Ставропольской, Октябрьской, Индустриальной и им. Захарова, расширена сеть учреждений образования, культуры и спорта, введены новые участки троллейбусных линий. При нем же в городе построили мемориальные комплексы — музей «Оружие Победы» и памятник «Жертвам фашизма».
Литвиненко живет со своей женой уже 58 лет, имеет двоих детей, четырех внуков и трех правнуков.
— Он из тех, для кого забота о нашем городе на многие годы стала образом жизни. В этот праздничный юбилейный день желаю Юрию Владимировичу крепкого здоровья, долголетия, семейного тепла и благополучия. За всю ту огромную работу, которую он сделал для города, за традиции благоустройства и многое что ещё — огромное спасибо! — написал глава Краснодара Евгений Первышов.